《福五鼠三十六计》故事发生在一个奇妙的世界里。有三个王国，猫王国、老鼠王国和狗王国。原来和平安乐彼此相处的世界，由于新的猫国国王（小气猫）为了自己的私欲，决定消灭鼠国占领狗国。由于鼠国老国王的懦弱，鼠国逐渐衰落。在鼠国快被消灭时，一个勇敢正义的老鼠（福福鼠）带着四个好友吉吉鼠、翔翔鼠、儒儒鼠、毅毅鼠挺身而出，因而演绎出一出出经典故事。
贼贼猫归隐山林后，过了几年，猫王小气猫又想攻打鼠国…… 猫国动员了十个军团的庞大兵力，前来进攻鼠国。.很快就打下了鼠国的要塞雷云关，鼠王吓的想要投降，福福鼠和他的朋友们决定和猫国决战。经过研究，他们认为猫国的军队数量虽然多鼠国三倍多，但他们有很多缺点。福五鼠决定运用孙子兵法的谋略，决定在锁龙山的困龙谷埋伏，歼灭猫国军团。